home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00270 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.8 KB  |  42 lines
  1. **********************************************
  2. * Heat shock hsp90 proteins family signature *
  3. **********************************************
  4.  
  5. Prokaryotic   and  eukaryotic  organisms   respond  to  heat  shock  or  other
  6. environmental  stress  by  the  induction   of   the  synthesis   of  proteins
  7. collectively known as heat-shock proteins (hsp) [1].  Amongst them is a family
  8. of proteins,  with  an  average  molecular weight of 90 Kd, known as the hsp90
  9. proteins. Proteins known to belong to this family are:
  10.  
  11.  - Escherichia coli heat shock protein c62.5 (gene htpG).
  12.  - Yeast HSC82, and HSP82.
  13.  - Drosophila hsp 82 (hsp 83).
  14.  - Trypanosoma cruzi hsp 85.
  15.  - Mammalian hsp 90-alpha (hsp 86) and hsp 90-beta (hsp 84).
  16.  - Chicken hsp 90.
  17.  - Plants Hsp82 or Hsp83.
  18.  - The endoplasmic reticulum  protein 'endoplasmin'  (also  known  as Erp99 in
  19.    mouse, GRP94 in hamster, and hsp 108 in chicken).
  20.  
  21. The exact function of  hsp90  proteins is not yet known. In higher eukaryotes,
  22. hsp90  has been found associated with steroid hormone receptors, with tyrosine
  23. kinase oncogene  products of several retroviruses,  with eIF2alpha kinase, and
  24. with actin  and  tubulin.  Hsp90  are probable chaperonins that possess ATPase
  25. activity [2,3].
  26.  
  27. As a signature pattern for the  hsp90  family of  proteins, we have selected a
  28. perfectly conserved   hexapeptide  found  in  the  N-terminal  part  of  these
  29. proteins.
  30.  
  31. -Consensus pattern: N-K-[DE]-I-F-L
  32. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  33. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  34. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  35.  
  36. [ 1] Lindquist S., Craig E.A.
  37.      Annu. Rev. Genet. 22:631-677(1988).
  38. [ 2] Nadeau K., Das A., Walsh C.T.
  39.      J. Biol. Chem. 268:1479-1487(1993).
  40. [ 3] Jakob U., Buchner J.
  41.      Trends Biochem. Sci. 19:205-211(1994).
  42.